肿瘤微环境与肿瘤的发生、进展和预后高度相关。本研究旨在探究低级胶质瘤(LGG)肿瘤微环境中免疫相关基因(IRG)的表达和免疫浸润模式。
我们使用表达数据(ESTIMATE)算法对恶性肿瘤组织中的基质细胞和免疫细胞进行了估算,以基于癌症基因组图谱数据集计算免疫和基质评分并确定预后的IRG。在功能富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络的帮助下,探讨了这些基因的潜在分子功能。值得注意的是,从中国胶质瘤基因组图谱数据库中下载的3个队列分析,进一步验证了这些基因的预后价值。此外,利用肿瘤IMmune估算资源(TIMER)算法估算了浸润免疫细胞的丰度,探索了LGG的免疫浸润模式。无监督聚类分析确定了三个免疫浸润模式的聚类,并表明CD8+ T细胞和巨噬细胞与LGG的结果显著相关。
总的来说,我们的研究确定了一系列预后性的IRG,为探讨LGG的免疫浸润模式提供了一个视角。
原始出处:
Xiangyang Deng, Dongdong Lin, et al., Profiles of Immune-Related Genes and Immune Cell Infiltration in the Tumor Microenvironment of Diffuse Lower-Grade Gliomas. J Cell Physiol. 2020 Mar 11. doi: 10.1002/jcp.29633.
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