尽管该报告作者都是欧洲人，但他们并没有单纯依据指南或欧洲组织的说法。相反，他们认为NCCN是采取“以一个更直接的方式新的治疗策略。”另一方面，他们认为“ESMO采取的是更为保守的方法”。
在乳腺癌
筛查、遗传风险评估、手术、系统性治疗、放射治疗和随访方面，两个指南存在差异。NCCN指南大多数从2014年开始实施，而ESMO指南大多数从2013年开始。
Zagouri博士和她的合作者指出：“ESMO和NCCN指南的根本差异在于表述方面。”
部分指南的差异是众所周知的，比如NCCN推每年筛查性的乳房钼靶检查(至少从40岁到70岁)，而ESMO则“没有明确的建议”。“ESMO指南是综述的形式，读者需要对数据进行总结和解读，”他们解释说，“相比之下，NCCN指南则是基于数据所提出的建议。”
差别举例
两个指南之间的其中一点“主要”差异在于遗传风险评估。
例如，ESMO指南只推荐测试BRCA突变，而NCCN指南“考虑广泛的不同的基因突变。” NCCN中指出，有证据表明更广泛的基因组筛查测试有意义。
“我们这些年来观察到，因为基因检测BRCA1/2成为可能，很多家庭的把关注点放在了BRCA相关的癌症发生上，而事实上这两个基因突变阴性并不代表疾病就不会发生。”NCCN小组主席、费城福克斯蔡斯癌症中心Mary Daly博士和副主席、哥伦布俄亥俄州立大学综合癌症中心Robert Pilarski博士共同指出。
“其他基因突变的检测在这些家庭中的肿瘤表型评估作用已经成熟，因此我们认为为这些家庭成员提供测试额外的基因是很重要的，这样他们就可以有更多降低患病风险的选择”他们说。
两人列举了两个例子说明除BRCA1/2之外的基因检测。
NCCN建议检测PTEN基因，因其能显著增加乳腺癌和其他癌症的患病风险。而p53基因，则能评估早发性乳腺癌和几种罕见癌症的患病风险。
此外，ESMO与NCCN之间在乳腺癌的手术治疗策略上也存在差异。腋窝分期就是其中最突出的一点。
NCCN指南说，该分期可以用于特别有利的肿瘤患者、老年人、有严重并发症的患者以及分期不影响辅助治疗的患者。但ESMO并没有阐述这一问题。
同样地，ESMO并没有定义称什么样的分期接受系统的新辅助治疗。但NCCN要求当最初的超声波和细针穿刺活检/核心活检出现阴性时，进行前哨淋巴结活检。此外，NCCN指出当淋巴结活检阳性时应进行腋窝淋巴结清扫。
两个指南在对使用放疗的建议上存在不少矛盾的地方。例如，对于加速部分乳腺照射(APBI)的应用有相当大的年龄差异。NCCN建议APBI只适用于淋巴结阴性、60岁及以上单个独立病灶疾病的女性患者；ESMO则允许在50年以上的女性使用。
在乳腺癌患者的随访要求方面，ESMO和NCCN指南有“重大”差异，围绕关于实验室检查和影像学检查的最优间隔问题。
NCCN指出乳房钼靶检查随访的时间间隔应该是每12个月，而ESMO则为每1到2年。总的来说，NCCN“不推荐”实验室检查，但ESMO则指出通过血常规检查监测患者接受内分泌治疗的情况。ESMO“不推荐”乳腺癌幸存者使用激素替代疗法，但NCCN并未提及这一点。ESMO推荐年轻患者，特别是那些高乳腺密度或具有遗传/家族病史的患者，但NCCN则没有定义MRI在这类人群随访中的作用。
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