Nat Commun：DNA甲基化和肥胖之间的关系

近日，在线发表在Nature Communications杂志上的一项研究论文中，四川农业大学和华大基因研究人员报道了猪脂肪及肌肉组织中的DNA甲基化信息，探究了DNA甲基化与肥胖之间的关系。

肥胖可以被视为一种流行病，在现代社会对人类健康有较大风险。肥胖已成为一些慢性疾病包括糖尿病、心血管疾病和癌症的一个重要的危险因素。据预测到2030年，全球成人人口中约58％的人可能超重或患有肥胖。

为了迎接这一挑战，全世界的研究人员为获得肥胖基因做出了巨大努力。虽然DNA序列中包含的所有信息使我们每个人都不一样，但我们的行为和外观的许多细节实际上是由基因调控的。四川农业大学的Mingzhou Li教授说，为了促进肥胖的研究，有必要了解表观遗传因素，特别是在肥胖发展中扮演一个重要角色的DNA甲基化。

为了研究DNA甲基化与肥胖之间的关系。在这项研究中，研究人员把猪作为研究模型。共选择三类猪种包括长白猪，藏族和荣昌猪。在表观数据的基础上，研究人员构建了全基因组DNA甲基化图以及研究脂肪和肌肉所需的基因表达图谱。

四川农业大学Xuewei Li教授说，根据DNA甲基化相关的基因组数据，我们对ATs和SMTS进行了一个全面的全基因组的表观遗传研究，我相信我们的结果为探索脂肪沉积的表观机制和肌肉的生长奠定了坚实的基础。

doi:10.1038/ncomms1854
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An atlas of DNA methylomes in porcine adipose and muscle tissues

Mingzhou Li,Honglong Wu,Zonggang Luo,Yudong Xia,Jiuqiang Guan,et al.

It is evident that epigenetic factors, especially DNA methylation, have essential roles in obesity development. Here, using pig as a model, we investigate the systematic association between DNA methylation and obesity. We sample eight variant adipose and two distinct skeletal muscle tissues from three pig breeds living within comparable environments but displaying distinct fat level. We generate 1,381 Gb of sequence data from 180 methylated DNA immunoprecipitation libraries, and provide a genome-wide DNA methylation map as well as a gene expression map for adipose and muscle studies. The analysis shows global similarity and difference among breeds, sexes and anatomic locations, and identifies the differentially methylated regions. The differentially methylated regions in promoters are highly associated with obesity development via expression repression of both known obesity-related genes and novel genes. This comprehensive map provides a solid basis for exploring epigenetic mechanisms of adipose deposition and muscle growth.