非结核分枝杆菌(NTM)是一种逐渐升级的威胁,特别是对于患有肺部合并症的患者。目前的床旁诊断无法充分识别和区分NTM物种与结核分枝杆菌(Mtb)。基于培养和分子的测试可能需要数周到数月的时间,并且需要将样品送到专门的诊断实验室。
在这个概念验证研究中,研究人员开发了一种基于PCR扩增16S核糖体RNA(rRNA)rrs基因的分析,使用通用的分枝杆菌引物和用一组二元脱氧核酶(BiDz)传感器对扩增片段进行查询
能够在物种水平鉴定NTM(BiDz-NTM ST)。每个BiDz传感器由RNA切割脱氧核酶的2个亚基组成,其仅在存在互补靶序列的情况下形成活性脱氧核酶催化核心。靶活化的BiDz催化报道基质的切割,从而根据所用的底物触发荧光或比色(视觉观察)信号。该小组包括BiDz传感器,用于区分6种临床相关的NTM物种(脓肿分枝杆菌,鸟分枝杆菌,胞内分枝杆菌,偶发分枝杆菌,堪萨斯分枝杆菌和结核分枝戈登)和结核杆菌。
结果显示,使用荧光BiDz-NTM ST测定,研究人员成功鉴定了38种临床分离株的种类。此外,用视觉BiDz传感器测试了一部分菌株,为肉眼观察NTM的物种分类提供了概念验证。
结论表明,BiDz-NTM ST试验是一种快速鉴定NTM物种的新平台。该方法具有高度特异性,并且比现有工具快得多,并且很容易适用于医院或临床实验室的现场诊断实验室。
原始出处:
Hillary N. Wood, Ashelyn E. Sidders, Lauren
E. Brumsey, Species Typing of Nontuberculous Mycobacteria by Use of
Deoxyribozyme Sensors
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