HIV-1基因全球多样性是开发HIV疫苗面临的重大挑战。本研究的目标是估计1990 - 2015年期间HIV-1亚型和重组体的区域和全球分布情况。通过一项全球调查收集了更多未发表的HIV-1分型数据。研究纳入了1990 - 2015年收集的HIV-1分型数据的流行病学研究。将国家分为14个区域,并分析了4个时间段(1990年99年、2000年04年、2005年09年和2010年15年)的数据。根据联合国艾滋病规划署对每个国家艾滋病毒感染者(PLHIV)数量的估计,对各国艾滋病毒1型、循环重组形(CRFs)和独特重组形(URFs)的分布情况进行加权,以生成每个时间段艾滋病毒1亚型多样性的区域和全球估计。主要结果是确定为HIV-1亚型A、B、C、D、F、G、H、J、K、CRFs和URFs的样本数量。该系统综述在普洛斯彼罗注册,编号为CRD42017067164。
该系统综述和全球调查在1990年至2015年间获得了2203个数据集,其中383 519个样本来自116个国家。2010年15年,全球所有HIV-1感染中,C亚型占46.6% (16 280 897/34 921 639 / PLHIV)。B亚型导致12.1%(4
235 299/34 921 639)的感染,其次是A亚型(10.3%);3 587 003/34 921 639), CRF02_AG(7.7%;2 705 110/34 921 639), CRF01_AE(5.3%;1 840
982/34 921 639), G亚型(4.6%;1 591 276/34 921 639), D亚型(2.7%;926
255/34 921 639)。F、H、J、K亚型合计占感染的0.9%(311 332/34 921 639)。其他CRFs占3.7%(1 309
082/34 921 639),使所有CRFs的比例达到16.7%(5 844 113/34 921 639)。URFs占全球HIV-1感染总数的6.1%(2
134 405/34 921 639),重组型占全球HIV-1感染总数的22.8%(7 978 517/34 921 639)。HIV-1亚型和重组体的分布随时间在国家、区域和全球发生变化。在2005 - 15年的全球水平上,B亚型增加,
A和D亚型稳定,
C和G以及CRF02_AG亚型下降。CRF01_AE、其他crf和URFs增加,导致重组型的整体比例随时间持续增加。全球和区域艾滋病毒多样性是复杂的和不断演变的,是艾滋病毒疫苗开发的一大挑战。监测艾滋病毒1型的全球分子流行病学对艾滋病毒疫苗的设计、检测和实施仍然至关重要。
原始出处:
Joris Hemelaar, DPhil, Global and regional
molecular epidemiology of HIV-1, 1990–2015: a systematic review, global survey,
and trend analysis
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