2019年全球大流行的新型冠状病毒病(COVID-19)由SARS-CoV-2感染引起,2019年12月在中国中部地区首次被报告。
2020年初,我国在人口最多的省份--广东进行了广泛的分子监测,从160万例检测中报告了1388例RNA阳性病例。
为了了解SARS-CoV-2在中国的分子流行病学和遗传多样性,研究人员利用元基因组测序和分层扩增子方法,从广东的感染者个体中生成了53个基因组。
综合流行病学和系统发育分析,研究人员发现广东有多个独立的疾病来源,尽管由于SARS-CoV-2在大流行初期的病毒遗传变异率较低,系统发育的聚类是不确定的。
该结果说明了当地传播链的时间、规模和持续时间是如何受到国家的旅行限制和广东省大规模的密集监测和干预措施的影响的。
尽管取得了这些成绩,但由于从其他国家输入的病例数量增加,广东的COVID-19监测工作仍然需要进行。
原始出处:
Jing Lu et al. Genomic Epidemiology of SARS-CoV-2 in Guangdong Province, China. CELL, 2020; doi: https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.04.023