疾病状态中有关性别差异的生物学基础还没有很好的建立。之前，已经有很多努力尝试去鉴定与特定疾病相关的特异性尿液代谢组情况。然而，在于性别相关的代谢组差异调查中，仍旧进展甚少，这也使得人们错误的认为风险因素和治疗方案在男性和女性患者中应该保持一致。
最近，有研究人员利用由健康女性和男性成年人提供的尿液样本，鉴定了有生物学意义的基线性别相关的差异。为了阐释是否尿液代谢特性在健康男性和女性之间具有很大的不同，研究人员利用初级代谢的代谢组学分析和综合的生物信息学分析对来自60名健康男性和女性的尿液样本进行了研究。研究发现，在男性中，α-酮戊二酸和4-羟基丁酸含量比女性分别多了2.3倍和4.41倍。更多的是，化学相似性富集分析阐释了代谢物的差异化存在，比如饱和脂肪酸、TCA和丁酸盐均与性别有显著的相关性。
最后，研究人员指出，这些发现表明了基线性别相关的尿液代谢差异是存在的，并且生物标记的开发、
诊断和膀胱疾病（间质性膀胱炎）的治疗也应该在上述差异中重新考虑。
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