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基孔肯雅病毒(CHIKV)是一种新出现的阿尔法病毒，已经感染了数百万人。然而，至今为止，我们对于调控疾病结果的因素仍然知之甚少。
最近，研究人员发现，在无菌小鼠或口服抗生素耗竭肠道微生物的常规饲养小鼠中，在病毒接种的1天内发生了更严重的CHIKV感染和传播。
微生物组的变化改变了浆细胞树突状细胞（pDCs）的TLR7-MyD88信号，并钝化了I型干扰素（IFN）的系统性产生。因此，循环中的单核细胞表达较少的IFN刺激基因，并允许CHIKV感染的发生。
此外，研究人员还发现，定植单一细菌物种，Clostridium scindens，或其衍生的代谢物，次级胆汁酸脱氧胆酸，就可以恢复pDC和MyD88依赖的I型IFN反应，以限制全身CHIKV的感染和向蚊媒的传播。
因此，共生肠道细菌在感染后数小时内通过胆汁酸-pDC-IFN信号轴调控抗病毒免疫和循环α病毒水平，从而影响病毒感染、传播和潜在的传播。
原始出处：
Emma S. Winkler et al. The Intestinal Microbiome Restricts Alphavirus Infection and Dissemination through a Bile Acid-Type I IFN Signaling Axis, CELL (2020). DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.029
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