Nature Genetics：发布癌症外显子组测序新成果

来自西班牙的研究人员确定了与膀胱癌相关的一些新遗传信号通路和新基因；了解这些患者的遗传标记是朝着认识这一疾病的生物学，改善患者治疗迈出的第一步。这项研究发表在《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。

膀胱癌在许多的国家，尤其在西班牙是一种严重的公共健康问题。在西班牙每年记录有11,200新增病例，是全球发病率最高的地区之一。大多数膀胱癌预后良好，确诊后的五年生存率为70-80%，大约80%的病例确诊时还没有浸润膀胱肌。

尽管如此，许多的肿瘤会出现复发，需要定期镜检进行肿瘤监测。这类后续追踪观察影响了患者的生活质量，同时也带来了显著的医疗费用。

西班牙国家癌症研究中心（CNIO）上皮癌研究组负责人Francisco X. Real，以及遗传与分子流行病学研究组负责人Nuria Malats，协调研究人员对非浸润性膀胱癌进行了首次外显子组测序。非浸润性膀胱癌是最常见的膀胱癌类型，并且具有最高的复发风险。

研究结果揭示了一些与疾病相关的如细胞分裂和DNA修复等新遗传信号通路，，以及新基因，这对于了解它的起源和进化有可能是至关重要的。

研究的主要作者、Real实验室的博士后研究人员Cristina Balbás说：“我们对于膀胱癌的生物学所知甚少，这些信息对于分类患者、预测复发甚至是阻止疾病都将是有用的。” 该研究对来自17名确诊膀胱癌患者的外显子组进行了分析，随后通过在另外的60名患者中检测一组特定基因验证了这一数据。

“我们发现了9个此前未曾在这类肿瘤种描述过的变异基因，其中我们发现STAG2在大约40%的最小侵袭性肿瘤中失活，”Real说。 研究人员补充说：“其中一些基因与从前未曾在膀胱癌中描述过的、一些如细胞分裂和DNA修复遗传信号通路有关；我们还证实并扩展了其他一些过去曾在这种癌症类型中描述过的遗传信号通路，如染色质重塑。”

膀胱癌中的一个未知因子

“2年前STAG2基因被发现与癌症相关，但对于它知之甚少，它与膀胱癌的关系我们也一无所知，”Balbás说。以往的研究表明在细胞分裂过程中它参与了染色体分离，这或许是它与癌症相关之处，并且它还被证实与DNA的3D结构维持以及基因表达相关。

根据Real所说，与预计的相反，这篇论文揭示这一基因变异的肿瘤染色体数目往往不发生改变，这表明这一基因是通过染色体分离之外的不同机制参与了膀胱癌。

作者们还通过分析670多名患者的肿瘤样本，发现STAG2变异与预后较好患者的肿瘤相关。

原文检索：

Cristina Balbás-Martínez,Ana Sagrera,Enrique Carrillo-de-Santa-Pau,Julie Earl,Mirari Márquez,Miguel Vazquez,Eleonora Lapi,Francesc Castro-Giner,Sergi Beltran,Mònica Bayés,Alfredo Carrato,Juan C Cigudosa,Orlando Domínguez,Marta Gut,Jesús Herranz, Núria Juanpere,Manolis Kogevinas,Xavier Langa,Elena López-Knowles,José A Lorente,Josep Lloreta,David G Pisano,Laia Richart,Daniel Rico,Rocío N Salgado,Adonina Tardón, Stephen Chanock,Simon Heath, Alfonso Valencia,Ana Losada,Ivo Gut,Núria Malats,Francisco X Real.Recurrent inactivation of STAG2 in bladder cancer is not associated with aneuploidy.Nature Genetics 2013 October 13 doi:10.1038/ng.2799 .