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背景和目标
肠道菌群失调与克罗恩病[CD]的发生发展有关，也可能在术后疾病复发[POR]中起重要作用。本项研究前瞻性地研究了回盲肠切除术后的粪便和粘膜微生物的组成，以确定与复发相关的微生物群的预测价值。
方法
在手术前后的计划时间点，研究人员收集了121例接受回盲肠切除术的CD患者的粘膜和/或粪便样本。同时对39个健康对照患者行回肠活检样本的收集。POR由Rutgeerts评分≥i2b定义。通过16S rRNA测序评估微生物群。使用C5.0和随机森林算法进行了预测分析。
结果
CD患者的粘膜相关菌群的特征是产生丁酸盐的微生物减少（[FDR] <0.01）以及富集的变形杆菌[FDR = 0.009]和阿克曼菌[FDR = 0.02]的增多。手术切除吻合后，除POR患者外，所有患者均可见粘膜藻科的粘膜富集[FDR <0.001]，与基线相比，梭菌科[FDR <0.001]也有所增加。没有POR的患者显示链球菌科[FDR = 0.003]和放线菌科[FDR = 0.06]减少。粘膜相关微生物群谱具有良好的判别能力来预测POR，并且优于临床指标。在第6个月，与没有POR的患者相比，经历POR的患者具有更多属于Negativicutes [FDR = 0.04]和Fusobacteria [FDR = 0.04]菌群组成。
结论
回盲患者的微生物群再定殖在复发患者和非复发患者之间是不同的，其中以梭状菌是最重要的导致早期POR的因素。
原始出处:
Kathleen Machiels. Et al. Early Postoperative Endoscopic Recurrence in Crohn’s Disease Is Characterised by Distinct Microbiota Recolonisation. Journal of Crohn's and Colitis.2020.
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