梅斯医学MedSci APP
医路相伴，成就大医
梅斯医学MedSci APP
医路相伴，成就大医
内皮细胞（EC）根据其所在的血管和组织表现出较大的功能异质性。虽然这些功能差异可能被印在了转录组中，但维持EC异质性的通路和网络尚未完全明确。
为了研究EC特异性的转录组基础，Paik等分析了来自Tabra Muris集团的小鼠组织特异性EC的单细胞RNA测序数据。
12种器官内皮细胞的单细胞转录组
经分析发现，通过单细胞RNA测序和组织块RNA测序产生的组织特异性EC转录组数据之间有很强的相关性，验证了该方法的可靠性。采用基于GRAPH的聚类算法，研究人员发现某些组织特定的EC明显根据器官而聚类（如，肝、脑），而其他组织来源的EC的转录组有明显的重叠（如，脂肪、心）。
Lars2在雄性EC中特异性表达
此外，研究人员还明确了可能与维持其特征的组织特异性EC和信号通路的新型标记。性别是内皮细胞转录组中异质性的重要来源，研究人员发现Lars2基因在雄性小鼠EC中高度富集。小鼠心脏和肺EC的标志物在人类胎儿心脏和肺EC中保守。通过分析配体和受体表达模式，研究人员还确定了组织特异性EC和其他细胞类型之间潜在的血管分泌相互作用。
总之，Paik等人通过对单细胞RNA测序数据进行分析揭示了维持组织特异性EC特征的转录网络，并发现了组织特异性EC之间的血管分泌和功能性相互作用。
原始出处：
David T. Paik, et al. Single-Cell RNA Sequencing Unveils Unique Transcriptomic Signatures of Organ-Specific Endothelial Cells. Circulation. 2020;142:1848–1862
Blood：镰状细胞病患者不同状态时的血浆微粒对内皮细胞的影响不同
0
2020-04-21
点击查看
Cell Death Dis：MLKL调控内皮细胞粘附分子的表达
0
2020-05-13
点击查看
Blood：单细胞测序揭示内皮细胞到造血干细胞前体的发育轨迹
0
2020-06-06
点击查看
Cell Stem Cell ：顾名夏团队揭示心内膜内皮细胞在左心室发育不良综合症中的全新作用
0
2020-08-18
点击查看
Blood：VEGF-C可保护骨髓血管周围微环境的完整性
0
2020-09-03
点击查看
Circulation：单细胞转录组学揭示不同器官内皮细胞的转录特征
0
2020-09-19
点击查看
