PNAS：哪些基因位点对紫外线特别敏感？

如果基因组包含对环境因素异常敏感的异常序列，那么这些序列将被用作监测个人致癌物暴露的前哨信号，并可能直接导致细胞生理上的变化，而不是通过罕见的突变起作用。

新方法adductSeq和freqSeq可以提供统计分辨率，使得我们可以在整个基因组中以单碱基分辨率对稀有病变进行定量。与紫外线（UV）诱导的环丁烷嘧啶二聚体（CPD）相比，原代人黑素细胞（而非成纤维细胞）携带自发的嘌呤位点和TG序列损伤的频率更高。

紫外线暴露表明，超热点获得CPD的频率比基因组平均频率高170倍。这些位点在黑素细胞中更为普遍。超级热点不成比例地位于基因序列附近，特别是对于RNA结合蛋白而言，最经常出现的超级热点位于2个基序内的固定位置。

其中，一个基序出现在ETS家族转录因子结合位点（已知为UV靶点），已有的数据显示其为基因组中最敏感的位点，位于mTOR / 5'末端寡嘧啶束翻译调节位点。

第二个基序出现在A2-15TTCTY，在紫外线照射后很长一段时间内会形成“深色CPD”，其对于CPD的修复缓慢，并且在实验之前已经积累了CPD。

在不同类型的细胞之间，作为超热点活跃的基序位置也有所不同。黑色素细胞中的CPD超级热点可以与黑色素瘤的单个基因启动子中的复发性UV特征突变，以及已知的癌症驱动因素精确对齐。

在晒伤级别的紫外线照射下，每个细胞在约20种靶向细胞途径中的每一种中都具有超热点CPD，让超热点充当表观遗传标记，造成表型不稳定。高患病率倾向于同时发生突变，这将允许肿瘤进化时使用弱驱动因子。

原始出处：

Premi S et al. Genomic sites hypersensitive to ultraviolet radiation. PNAS, 2019; DOI: 10.1073/pnas.1907860116. 

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