STROBE-宏基因组学：指导宏基因组学研究报告的 STROBE 扩展声明

宏基因组学一词是指使用测序方法从样本中存在的所有生物体中同时识别基因组材料，其优势是比培养或其他方法具有更高的分类分辨率。应用包括病原体检测和发现、物种表征、抗菌素耐药性检测、毒力分析以及影响健康的微生物组和微生态因素的研究。然而，宏基因组学涉及复杂和多步骤的过程，并且存在需要仔细考虑以支持有效推理的重要技术和方法挑战。我们协调了一个多学科的国际专家组来制定报告指南，这些指南涉及样本处理、核酸提取、测序平台、生物信息学考虑、质量保证、检测限、功率和样本量、验证性测试、因果关系标准、成本和伦理道德问题。该指南认识到宏基因组学研究需要务实和谨慎的解释，并且该领域正在迅速发展。