空间染色质 spATAC-seq
2025-02-03发表于陕西省
2025-02-03发表于陕西省
#spATAC-seq# 染色质开放性反映了转录因子等反式作用因子在DNA复制或转录过程中与顺式调控元件结合的程度。这一特性与基因调控的活性密切相关。海量的单细胞染色质开放性测序(scATAC-seq)数据,能够细致刻画细胞间的异质性,并为解析生物调控网络的运行机制提供了宝贵信息。
近年来,空间组学技术逐渐成熟。空间染色质开放性测序(spATAC-seq)作为空间组学的重要分支,不仅能揭示组织的表观遗传特征,还提供每个测序位点的空间位置信息,为研究表观遗传异质性和组织空间结构的关联提供了全新视角。
整合分析一直是空间组学领域中的重要课题,其旨在通过多样本联合建模,消除数据中非生物学因素(如批次效应和随机噪声)的干扰,保留充足的生物学信号,使不同样本之间具有可比性,同时提升统计分析的性能。通过对于spATAC-seq数据的多样本整合,可以增强对组织、器官乃至生物体的空间结构以及发育动态的解析,更全面地刻画组织结构,构建全局表观遗传图谱,从而挖掘生物学信息并解析调控逻辑。然而,目前尚缺乏专门针对多样本spATAC-seq数据的整合方法,阻碍了针对这类数据的多样本协同分析。
2025-02-03发表于浙江省